На фоне выразительной декорации из гранитных скал лежит священный остров, где Храм богини Исиды вздымает свои колонны и пилоны к ясно-голубому небу, создавая у посетителей впечатление ирреальности увиденного. Храм в Филе, как и храмы Эдфу и Дендеры, одно из трех наиболее сохранившихся сооружений эпохи Птолемеев.
После постройки в 1904 году первой плотины на первом пороге Нила храм был затоплен водой большую часть года. Его можно было посетить только в августе - единственный период, когда открывались все шлюзы, чтобы не допустить слишком большого паводка. При строительстве большой Асуанской плотины потребовалось разобрать храм, перенести на 150 метров севернее на остров Эджелика и восстановить в идеальной точности.
Культ Исиды на острове Филе восходит к глубокой древности. Традиция требовала, чтобы по крайней мере раз в год каждый египтянин совершил сюда паломничество.
Филе - самый маленький из трех островов, которыми заканчивается на юге группа скал, образующих первый порог: он имеет около 400 м в длину и 135 м в ширину. Монументальный ансамбль святилища богини находится на юге острова: древние египтяне верили, что чудодейственный, благодатный разлив Нила начинался в этом месте.
В 535 г. н.э. после того, как Юстиниан завершил христианизацию Нубии, епископ Федор превратил храм в церковь Святого Стефания.
Южная оконечность островка занята павильоном Нектанеба I. Это беседка, поддерживаемая четырнадцатью колоннами. Нектанебу I мы обязаны сооружением первого пилона храма Исиды, нижняя часть которого украшена большой композицией, представляющей фараона Птолемея XIII, приносящего в жертву богам - Хатфор и Хору - пленных врагов.